При совершении каждой трансакции системой взимается комиссия за обеспечение информационного и технологического взаимодействия между участниками расчетов в системе WebMoney Transfer в размере 0.8% от суммы платежа, но не менее 0.01WM*. При этом максимальный размер комиссии составляет:
| WMZ | 50 | 
| WME | 50 | 
| WMM | 500 | 
| WMG | 1 | 
| WMX | 1 | 
| WMH | 30 | 
| WML | 150 | 
| WMF | 10 | 
| WMT | 50 | 
| WMS | 500 000 | 
Комиссия не взимается в случаях проведения трансакций:
- между однотипными кошельками одного WM-идентификатора;
- между однотипными кошельками одного Аттестата (для участников, имеющих
аттестат не ниже начального).
Может взиматься дополнительная комиссия при выполнении операций с подтверждением c использованием номера телефона указанного при регистрации
За совершение кредитных сделок с владельцев кошельков типа D системой взимается комиссия за обеспечение информационного и технологического взаимодействия между участниками расчетов в системе WebMoney Transfer в размере 0.1% от суммы каждого предоставленного ими кредита, но не менее 0.01 WMZ.
За операции по вводу/выводу средств в/из системы, взимается плата в соответствии с действующими тарифами агентов: